Nadat de wereld in zee is verdwenen, is De Stad – gebouwd op een steile berg – het laatste toevluchtsoord waar mensen wonen. Er heerst achterdocht en wantrouwen, want iedereen is bang voor een duistere kracht (Vijand) die mensen in bezit neemt en dood en verderf zaait. Als er een walvis aanspoelt met een vreemde jongen in zijn buik, denken de bewoners meteen dat de Vijand weer iemand heeft uitgezocht en eisen zijn dood. Alleen Ellie, een jonge uitvindster, gelooft dat de jongen onschuldig is en zet alles in om hem te redden.